Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga1E1U8D0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms