Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms