Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa28D3Z1V9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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