Protein–RNA interactions for Protein: D3YYW9

1500009C09Rik, RIKEN cDNA 1500009C09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500009C09RikD3YYW9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1500009C09RikD3YYW9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1500009C09RikD3YYW9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1500009C09RikD3YYW9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1500009C09RikD3YYW9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1500009C09RikD3YYW9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1500009C09RikD3YYW9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1500009C09RikD3YYW9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1500009C09RikD3YYW9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1500009C09RikD3YYW9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
1500009C09RikD3YYW9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1500009C09RikD3YYW9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1500009C09RikD3YYW9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
1500009C09RikD3YYW9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1500009C09RikD3YYW9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1500009C09RikD3YYW9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms