Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms