Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms