Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17333C6EQI3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms