Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.4□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms