Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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