Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms