Protein–RNA interactions for Protein: B2RSH2

Gnai1, Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnai1B2RSH2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gnai1B2RSH2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gnai1B2RSH2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gnai1B2RSH2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gnai1B2RSH2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gnai1B2RSH2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms