Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms