Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox1B1APN4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms