Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprsB0V2N1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms