Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr16A3KMN5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prr16A3KMN5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms