Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms