Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Btbd35f28A2CFD5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Btbd35f28A2CFD5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms