Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms