Protein–RNA interactions for Protein: A2A9F4

Kdf1, Keratinocyte differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdf1A2A9F4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdf1A2A9F4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms