Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms