Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
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