Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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ATG3Q9NT62 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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ATG3Q9NT62 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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ATG3Q9NT62 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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ATG3Q9NT62 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATG3Q9NT62 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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