Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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LHX9Q9NQ69 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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