Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERGIC2Q96RQ1 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms