Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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