Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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ZNF239Q16600 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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ZNF239Q16600 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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