| ATP6AP1 | Q15904 | AC109486.1-201 | ENST00000486833 | 374 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MTND1P22-201 | ENST00000510572 | 951 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORA31.18-201 | ENST00000517043 | 134 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC130415.1-201 | ENST00000547569 | 1010 nt | TSL 4 BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MRPS36P5-201 | ENST00000551909 | 298 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC123905.1-201 | ENST00000552098 | 541 nt | TSL 4 BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR4658-201 | ENST00000584344 | 65 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR548AB-201 | ENST00000584917 | 84 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | HMGN1P30-201 | ENST00000589286 | 268 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC005261.5-201 | ENST00000596280 | 355 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC073544.2-201 | ENST00000601155 | 540 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC104763.2-201 | ENST00000604179 | 382 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL359999.1-201 | ENST00000604513 | 294 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL121917.1-203 | ENST00000605534 | 577 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC103810.6-201 | ENST00000606708 | 136 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-87P-201 | ENST00000607561 | 108 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL365204.3-201 | ENST00000612448 | 685 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL589743.7-201 | ENST00000612637 | 233 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC091304.6-201 | ENST00000619761 | 202 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC009878.1-201 | ENST00000621819 | 340 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC092608.2-201 | ENST00000624427 | 218 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | Z99571.1-201 | ENST00000636677 | 394 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MTND5P42-201 | ENST00000637720 | 498 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC099654.13-201 | ENST00000639774 | 207 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | EBAG9-210 | ENST00000620557 | 2186 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | WWP1-201 | ENST00000265428 | 3362 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | STX7-202 | ENST00000367941 | 15791 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | NACAP2-201 | ENST00000318548 | 624 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | C6orf62-201 | ENST00000378102 | 741 nt | TSL 5 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-946P-201 | ENST00000383878 | 107 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU1-52P-201 | ENST00000384190 | 164 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC051618.1-201 | ENST00000414295 | 207 nt | TSL 3 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC092809.3-201 | ENST00000415453 | 231 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC096649.2-201 | ENST00000416186 | 393 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL138962.1-201 | ENST00000417987 | 411 nt | TSL 5 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC016710.1-201 | ENST00000421326 | 466 nt | TSL 3 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL365203.2-201 | ENST00000423444 | 196 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | TTTY8-202 | ENST00000426035 | 518 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | PGBD4P3-201 | ENST00000440731 | 581 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | LINC01683-201 | ENST00000443479 | 412 nt | TSL 3 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | HMGN2P10-201 | ENST00000448085 | 265 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | USP9YP12-201 | ENST00000450481 | 570 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR4435-2HG-213 | ENST00000451884 | 423 nt | TSL 3 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MTATP6P7-201 | ENST00000453315 | 681 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | TTTY8B-202 | ENST00000455570 | 518 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL137847.2-201 | ENST00000458111 | 527 nt | TSL 3 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU7-26P-201 | ENST00000458980 | 63 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | LINC02462-201 | ENST00000503009 | 430 nt | TSL 5 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC010587.1-201 | ENST00000505809 | 469 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | APELA-204 | ENST00000515275 | 551 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU2-10P-201 | ENST00000516375 | 211 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC106038.2-201 | ENST00000520706 | 568 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC087318.1-201 | ENST00000536786 | 389 nt | TSL 3 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | NACAP3-201 | ENST00000552100 | 481 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC109446.2-201 | ENST00000567872 | 497 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC135628.1-201 | ENST00000568867 | 534 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC009127.3-201 | ENST00000570531 | 403 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC024619.4-201 | ENST00000580924 | 316 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC090616.5-201 | ENST00000581225 | 299 nt | TSL 5 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR5007-201 | ENST00000583098 | 95 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC011477.3-201 | ENST00000585571 | 403 nt | TSL 5 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | TCF4-AS2-201 | ENST00000586467 | 445 nt | TSL 2 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC016229.1-201 | ENST00000589242 | 487 nt | TSL 5 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RPS15AP11-201 | ENST00000594193 | 385 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC012065.4-201 | ENST00000602445 | 679 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | BNIP3P9-201 | ENST00000603714 | 553 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL355598.1-201 | ENST00000604169 | 202 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC112191.3-201 | ENST00000604371 | 277 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC092354.1-201 | ENST00000606057 | 376 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC135507.2-201 | ENST00000612443 | 309 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC130324.3-201 | ENST00000614165 | 542 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC245884.12-201 | ENST00000615364 | 59 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC007998.5-201 | ENST00000622938 | 237 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | FRG1KP-201 | ENST00000623592 | 341 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | OR4C15-202 | ENST00000642128 | 951 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | KPNA5-202 | ENST00000368564 | 11311 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | KIF20B-202 | ENST00000371728 | 6419 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | PICALM-209 | ENST00000528398 | 2049 nt | TSL 2 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | TTK-202 | ENST00000369798 | 3010 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | CEP57-213 | ENST00000541150 | 2911 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AK9-203 | ENST00000368948 | 2478 nt | TSL 5 BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | ACTR6-212 | ENST00000552376 | 1659 nt | TSL 5 BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AGL-204 | ENST00000370161 | 6923 nt | TSL 5 BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | DEFB107A-201 | ENST00000335021 | 389 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | DEFB107B-201 | ENST00000355602 | 389 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AKR1C1-201 | ENST00000380859 | 858 nt | TSL 3 BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORA6-201 | ENST00000384033 | 151 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | Y_RNA.534-201 | ENST00000384599 | 112 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR128-1-201 | ENST00000384921 | 82 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL589872.1-201 | ENST00000426602 | 288 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RPL7P34-201 | ENST00000433316 | 712 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC018634.1-201 | ENST00000437554 | 401 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MTND1P30-201 | ENST00000441241 | 901 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL451164.2-201 | ENST00000445932 | 597 nt | TSL 2 BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AF127577.5-201 | ENST00000449746 | 446 nt | TSL 3 BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-953P-201 | ENST00000459154 | 107 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | TRBV1-201 | ENST00000476502 | 284 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC026780.2-201 | ENST00000503489 | 730 nt | TSL 5 BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC108935.1-201 | ENST00000504874 | 518 nt | TSL 2 BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC097467.3-212 | ENST00000512269 | 568 nt | TSL 3 BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |