Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms