Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
USF2Q15853 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
USF2Q15853 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
USF2Q15853 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USF2Q15853 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USF2Q15853 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
USF2Q15853 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USF2Q15853 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
USF2Q15853 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
USF2Q15853 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
USF2Q15853 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
USF2Q15853 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
USF2Q15853 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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