Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
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