Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP10Q15642 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
TRIP10Q15642 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
TRIP10Q15642 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
TRIP10Q15642 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRIP10Q15642 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRIP10Q15642 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRIP10Q15642 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRIP10Q15642 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms