Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
SEMA3AQ14563 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3AQ14563 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms