Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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