Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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CBX3Q13185 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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CBX3Q13185 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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