Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.7 ms