Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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TRAF1Q13077 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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TRAF1Q13077 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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TRAF1Q13077 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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TRAF1Q13077 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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TRAF1Q13077 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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TRAF1Q13077 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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TRAF1Q13077 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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