Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
STRN3Q13033 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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STRN3Q13033 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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STRN3Q13033 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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STRN3Q13033 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
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