Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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