Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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