Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARXQ96QS3 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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