Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
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LAMA3Q16787 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
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LAMA3Q16787 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
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LAMA3Q16787 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
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LAMA3Q16787 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
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LAMA3Q16787 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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