Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ALX1Q15699 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ALX1Q15699 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ALX1Q15699 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ALX1Q15699 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ALX1Q15699 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ALX1Q15699 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ALX1Q15699 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ALX1Q15699 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ALX1Q15699 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ALX1Q15699 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ALX1Q15699 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ALX1Q15699 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ALX1Q15699 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ALX1Q15699 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
ALX1Q15699 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
ALX1Q15699 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
ALX1Q15699 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ALX1Q15699 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ALX1Q15699 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ALX1Q15699 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ALX1Q15699 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ALX1Q15699 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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