Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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