Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms