Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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