Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
APOFQ13790 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
APOFQ13790 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
APOFQ13790 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
APOFQ13790 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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APOFQ13790 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
APOFQ13790 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
APOFQ13790 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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APOFQ13790 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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APOFQ13790 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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APOFQ13790 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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APOFQ13790 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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APOFQ13790 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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APOFQ13790 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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APOFQ13790 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
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