Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX3Q13761 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX3Q13761 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.8 ms