Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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