Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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ERCC8Q13216 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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ERCC8Q13216 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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ERCC8Q13216 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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ERCC8Q13216 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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ERCC8Q13216 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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ERCC8Q13216 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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