Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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