Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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